儿童感统训练课程以孩子感统能力的培养为开始，为孩子提供注意力、规则服从和观察学习等自然学习技能的课程内容，并且动作技能的训练等帮助孩子发展正规学习技能。自然学习能力和正规学习技能所形成的基础学习能力是孩子适应未来学校学习的能力基础。

儿童言语康复训练课程遵循言语语言获得和发展规律，使用RPRAP（呼吸、发声、共鸣、构音、语音）理论和B.F.Skinner的语言行为作为教学原理，将国内口部运动治疗和美国口部定位治疗相结合， 帮助孩子言语能力，并且安排测评进行科学评估，及时干预孩子的教学进度。

自闭症是发育障碍的一种形式，目前只能干预训练帮助孩子促进语言交流能力、社会交往能力、培养基本的学习和生活技能。南京子曰儿童发展中心的自闭症课程以推动孩子语言认知发展为目标，帮助孩子构建语言体系并且运用该体系来认知世界和自我。